藏医学是藏族传统文化十明之学的五大明之一，又悠久的历史、独特的理论基础和科学完整的体系，基于龙、赤巴、培根的三因学说，与先进的胚胎学说和形象的树喻学说以及神奇的藏医学一并构成了这门完整学科的独特体系。
天文历算学也是十明文化之一，它是以原始的西藏历学为基础，时轮历为主体，五行占算和时宪历为补充逐渐发展起来的一门学科，其研究领域大，辐射面广，涉及到多个相关学科。
从整体而言，俗称的十明之学基本上涵盖了西藏所有传统文化内容，其中每种学科都是一门单独的学科门类，而各学科之间的关系又是互相联系，互为辅助的，因而，要精通其中的一门学科，则必须具备相关学科的相应知识作为基础和辅助。而精通十明之学的人，则以其博大精深的学识被冠以"班智达"的美称。藏医与历算之间有着密不可分的关系，无论从二者的历史渊源，还是从理论基础来看都是如此。下面试从这两方面探讨藏医与历算之间的关系问题。
公元前2世纪左右聂赤赞普时期，出现了12位苯教徒，其中便有医者和“卜卦占算”的算者，说明当时便有专门从事藏医和历算的人员。
公元7世纪，吐蕃王朝建立后，统一了文字，确立了法典，采取了大兴佛教、振兴藏医和历算等一系列政策，从当时的唐朝印度、大食等邻近各国吸收了先进的医学和历算学内容，从而使藏医学和天文历算学得到了长足的进步和发展，特别是藏医鼻祖宇妥宁玛•云丹贡布成名以后，编写了藏医经典名著《四部医典》等诸多藏医典籍和《历算山尘论》等历算学著作，培养了无数藏医人才。与此同时，藏医九圣和历算七贤也分别在藏医和历算方面颇有建树。
随着佛教的传入，其他文明也随之传入西藏，密法的传入更是形成了藏传佛教独有的特色。在公元11世纪初，无上瑜伽部的经典巨作《时轮法摄略经》及其注疏的传入标志着无上密部在西藏进入了一个兴盛的时期。特别是时轮法的内容更值得研究和探讨。时轮经共分五品，第一品，主要讲述宇宙世界的形成，日月五星的运动，闰月的设置，日月食的推算等项内容，西藏天文历算的主题部分即“时轮历”便是由此产生。第二品，主要讲述人体的形成，脉轮的分布，十大气的功能，疾病的成因，各种药物的配制等内容。其他三品讲的则是灌顶、修法、指挥等修炼之法。时轮法的内容可以归结为外、内、密三时轮。外时轮主要讲述外部五行的生、化、克、养规律包括宇宙世界的形成，日月星辰的运行、时空的流转、四季的更替等。内时轮主要讲述人体内部五行的相生相克、均衡失衡原理，气脉轮的形成与走向，无病长寿之法，疾病消除之法。内时轮又互依互存、密不可分，若能悟其真理，内外结合，精研密修，则能证得圆满菩提，这种内外结合之法便是“密时轮”。时轮法的内容博大精深，特别是这种内外结合的特殊修炼方法在涉藏州县广为传播。藏医与历算的关系由此也可见一斑。
随着藏医、历算的广泛传播和研究的进一步深入，藏医形成了强、苏二派，历算也分为粗、浦两派，不同学派的创立以及各自学说的完善，对藏医和历算之学进入了一个空前发展的时期。各派学说均有建树。就各学者的身份而言，多数是佛学大家，有的既是藏医学家，又是历算学家。如历史上出现了萨迦五祖之列的扎巴坚赞和萨班•贡嘎坚赞、布顿•仁青珠巴、噶玛•让琼多吉、达布拉杰、强巴南杰札桑、松巴益西班觉、苏克罗周杰布、觉囊•达热那塔、第司•桑杰嘉措精通藏医和历算之学，创立了药王山利众医学院，主持绘制了80幅藏医唐卡，厘定了《四部医典》，著有《四部医典》注释本《蓝玻璃》、《历算答疑》等历算学经典著作，对后世影响巨大。十三世达赖喇嘛时期，于1916年创建了;拉萨门孜康，任命精通医药历算的钦绕罗布大师为院长，分科设立藏医和历算两个专业，特别注重医、算两用人才的培养。对两科双修成绩优秀的学生要授予一等学生第一名的称号并颁发相应的证书，对藏医和历算两科考试都通过者授予一等学生的称号，对医、算两用人才经噶夏政府批准，毕业后享有一些特殊的待遇。“门孜康”直译为汉文便是医算院、西藏自治区藏医院的藏文名字至今仍然保留着原来的名字--门孜康，建院已有80多年的历史。而今，西藏天文历算研究所和藏医研究所一同挂靠在西藏自治区藏医院，就是出于这样一种历史渊源关系而形成的。